Filipović studierte Katholische Theologie, Kommunikationswissenschaft und Germanistik. Seine medienethische Dissertation „Christliche Sozialethik und die öffentliche Kommunikation der Wissensgesellschaft“ wurde 2006 mit dem Kulturpreis Bayern ausgezeichnet. Seit 2011 ist er Berater der Publizistischen Kommission der Deutschen Bischofskonferenz und Mitautor des medienethischen Impulspapiers "Virtualität und Inszenierung" der Deutschen Bischofskonferenz. Bis Januar 2021 war er Professor für Medienethik an der Hochschule für Philosophie in München, 2018-2020 Mitglied in der Enquete-Kommission des Deutschen Bundestages zur Künstlichen Intelligenz. Seit Februar 2021 ist er Professor für Christliche Sozialethik an die Katholisch-Theologischen Fakultät der Universität in Wien. Er gibt u. a. die medienethische Zeitschrift Communicatio Socialis mit heraus.