Dierken studierte Theologie und Philosophie. Ab 1995 war er Professor für Systematische Theologie mit den Schwerpunkten Ethik und Religionsphilosophie an der Universität Hamburg, seit 2010 Professor für Systematische Theologie/Ethik an der Universität Halle-Wittenberg. Schwerpunkte u.a.: Grundlagen theologischer Ethik, aktuelle materialethische Probleme (Medizin und Biopolitik, Recht, Ökonomie u.a.m.).